【 自然遺産（計３地域）】
・屋久島（平成５年１２月）
世界的に特異な樹齢数千年のヤクスギをはじめ、多くの固有種や希少種を含む生物相を有するとともに、植生の典型的な垂直分布がみられるなど、特異な生態系とすぐれた自然景観を有する。
・白神山地（平成５年１２月）
原生的な状態で残存するブナ林は、動植物相の多様性で世界的にも特異な森林であり、生態学的に進行中のプロセスを示す顕著な見本である。
・知床（平成１７年７月）
北半球で最も低緯度で流氷を観察することができ、海と陸の生態系の顕著な見本であるとともに、多くの希少種等が生息する重要な地域である。
【 文化遺産（計１０地域）】
・姫路城（平成５年１２月）
・法隆寺地域の仏教建造物（平成５年１２月）
・古都京都の文化財（平成６年１２月）
・白川郷・五箇山の合掌造り集落（平成７年１２月）
・原爆ドーム（平成８年１２月）
・厳島神社（平成８年１２月）
・古都奈良の文化財（平成１０年１２月）
・日光の社寺（平成１１年１２月）
・琉球王国のグスク及び関連遺産群（平成１２年１２月）
・紀伊山地の霊場と参詣道（平成１６年７月）
